On l’appelait autrefois « flore intestinale ». Le microbiote intestinal fait aujourd’hui l’objet de milliers de travaux de recherche, et pour cause : cet ensemble de micro-organismes participe à de nombreuses fonctions de l’organisme. De quoi est-il composé, à quoi sert-il et qu’est-ce qui l’influence ? Voici 5 points pour comprendre l’essentiel.
1. Le microbiote intestinal, c’est quoi ?
Le microbiote intestinal désigne l’ensemble des micro-organismes qui vivent dans notre tube digestif. Il s’agit surtout de bactéries, mais aussi de virus, de levures et d’autres micro-organismes. D’après l’Inserm, notre intestin en abrite entre mille milliards et cent mille milliards (10¹² à 10¹⁴). La grande majorité se concentre dans le côlon, la dernière partie de l’intestin, où l’on compte jusqu’à plusieurs milliers de milliards de bactéries par millilitre de contenu.
Microbiote, flore intestinale, microbiome : quelle différence ?
« Flore intestinale » est l’ancien nom du microbiote. On sait aujourd’hui que ces micro-organismes ne sont pas des végétaux, d’où l’abandon progressif du mot flore. Le terme microbiome désigne, lui, l’ensemble des gènes de ces micro-organismes, bien plus nombreux que les gènes humains.
2. Un écosystème propre à chacun
Le microbiote est un peu comme une empreinte : chacun possède le sien. Selon l’Inserm, environ un millier d’espèces bactériennes différentes ont été identifiées dans l’intestin humain, et chaque personne en porte en moyenne 160. Seule la moitié de ces espèces se retrouve couramment d’une personne à l’autre. Un socle de 15 à 20 espèces serait commun à tous les êtres humains.
Cette diversité explique pourquoi deux personnes ne réagissent pas toujours de la même façon à un même aliment, et pourquoi les chercheurs s’intéressent autant à la composition du microbiote.
Un équilibre qui évolue au fil de la vie
Le microbiote se met en place pendant les premières années de vie et se diversifie avec l’alimentation, puis reste relativement stable à l’âge adulte. Il continue toutefois d’évoluer au gré des changements d’alimentation, des voyages ou de la prise de médicaments, et se modifie encore avec l’avancée en âge.
3. À quoi sert le microbiote intestinal ?
Il participe à la digestion
Le microbiote fermente les résidus alimentaires que nos propres enzymes ne savent pas digérer, en particulier certaines fibres alimentaires. Il intervient aussi dans la synthèse de certaines vitamines, comme la vitamine K et certaines vitamines du groupe B. En fermentant les fibres, certaines bactéries produisent des acides gras à chaîne courte, comme le butyrate, que les cellules du côlon utilisent notamment comme source d’énergie.
Il dialogue avec le système immunitaire
Dès les premières années de vie, le microbiote aide le système immunitaire intestinal à distinguer les micro-organismes inoffensifs de ceux qui peuvent poser problème. Certaines bactéries limitent aussi l’installation d’espèces indésirables, en occupant la place et en produisant des substances antibactériennes.
4. Ce qui influence le microbiote
Le microbiote se construit dès la naissance. Son installation dépend notamment du mode d’accouchement : par voie basse, le nouveau-né est d’abord colonisé par les bactéries maternelles ; après une césarienne, par celles de son environnement. Le microbiote évolue ensuite toute la vie, sous l’effet de plusieurs facteurs :
- l’alimentation, qui joue un rôle majeur dans sa composition ;
- les antibiotiques, qui réduisent la quantité et la diversité des bactéries pendant plusieurs jours à plusieurs semaines ;
- la génétique, l’hygiène, l’environnement, les traitements médicaux et les hormones.
5. Les bons gestes au quotidien
Il n’existe pas de recette miracle, mais une hygiène de vie équilibrée reste la meilleure base :
- manger varié, en faisant une bonne place aux fibres : légumes, fruits, légumineuses, céréales complètes ;
- intégrer de temps en temps des aliments fermentés, comme le yaourt, le kéfir ou la choucroute crue ;
- ne prendre des antibiotiques que sur prescription, en respectant la durée indiquée par le médecin ;
- bouger régulièrement et prendre soin de son sommeil.
Concrètement, les repères du Programme national nutrition santé invitent à consommer au moins cinq portions de fruits et légumes par jour, des légumineuses au moins deux fois par semaine et des féculents complets chaque jour.
Pour aller plus loin, retrouvez nos 7 piliers d’une bonne santé.
Et les probiotiques ?
Les probiotiques sont des micro-organismes vivants que l’on trouve dans certains aliments ou sous forme de compléments alimentaires. Le Complexe Probiotiques Anosia réunit six souches de ferments lactiques, dont des lactobacilles et des bifidobactéries, pour un total de 25 milliards d’UFC (unités formant colonie) par dose de 6 gélules, associées à des fibres (fructo-oligosaccharides). À ce jour, aucune allégation de santé n’est autorisée en Europe pour les probiotiques. Ce complément est déconseillé aux enfants de moins de 6 ans et ne se substitue pas à une alimentation variée et équilibrée et à un mode de vie sain.
En résumé
Le microbiote intestinal rassemble des milliers de milliards de micro-organismes, différents d’une personne à l’autre. Il participe à la digestion de certaines fibres et à la synthèse de vitamines, et dialogue en permanence avec le système immunitaire. L’alimentation reste l’un des leviers les plus simples pour en prendre soin : variée, riche en fibres et en végétaux, avec une place pour les aliments fermentés.



